义乌软件著作权申报的办理机构及流程如下：

一、申报机构

义乌软件著作权申报需在中国版权保护中心办理，该机构是国务院知识产权行政部门认定的唯一软件登记机构，负责全国软件著作权登记工作。

二、申报方式

现场办理

可前往中国版权保护中心杭州分中心的登记大厅办理。

邮寄申请

支持通过挂号信函或特快专递邮寄申请材料至中国版权保护中心软件登记部。

三、所需材料

根据《计算机软件著作权登记办法》第九条规定，需提交以下材料：

1. 填写完整的软件著作权登记申请表；

2. 软件的鉴别材料（如源代码、设计文档等）；

3. 相关证明文件（如开发合同、项目计划书等）。

四、注意事项

登记费用

软件著作权登记实行自愿登记制度，但需缴纳工本费（约80元/件）。

审查流程

提交材料后，版权保护中心会进行形式审查，通过后会在官网公告登记信息，公告期满后核发证书。

特殊情况处理

若材料不齐全，需按中心要求补充完整后再行提交。

五、补充说明

义乌本地未设代办机构，需通过上述官方渠道办理。若需咨询，可拨打010-68003934或64097080查询。

以上信息综合自中国版权保护中心官方指南及权威平台。