《汤姆·索亚历险记》中确实存在一些令人困惑或感到奇怪的情节，主要与人物行为动机和情节逻辑相关。以下是具体分析：

目睹凶杀却闭口不提

汤姆和哈克目睹乔埃杀害医生鲁宾逊并嫁祸醉鬼彼得，但因害怕凶悍的乔埃而相互发誓保密。这一行为与后文他们出庭为彼得作证形成矛盾，引发读者对正义感与恐惧心理的困惑。

法庭作证与情节矛盾

小说中提到“镇上要开庭审理彼得杀人案，汤姆和哈克出庭为彼得作证”，但此前并未明确说明两人为何会站出来作证。这种突兀的转折可能让读者对两人动机产生疑问，是否仅是出于友情或逃避责任。

人物性格的多面性

汤姆既顽皮捣蛋（如逃课、搞恶作剧），又表现出勇敢正直（如指证凶手）。这种反差性格使部分读者难以理解其行为逻辑，例如为何会在关键时刻挺身而出。

社会背景与现实隐喻

小说虽以19世纪美国小镇为背景，但通过荒诞情节（如“海盗”梦、墓地探险）讽刺了当时社会的虚伪与刻板。这种隐喻手法可能让读者在理解具体情节时产生困惑，需结合历史背景分析。

总结：

小说的困惑点主要源于人物行为动机与情节逻辑的矛盾，以及反差性格的塑造。通过深入分析人物心理和社会背景，可更好地理解这些看似奇怪的情节。