深圳的软件公司主要集中在 南山区和福田区。

南山区：

南山区是深圳软件产业的重要聚集地，拥有众多大型软件公司，如腾讯等。南山区的大公司数量最多，名气最大。

福田区：

福田区也是软件公司集中的重要区域，聚集了大量的软件开发企业和创业团队。福田区的软件产业以高科技园区为中心，如福田中心区、南山科技园等，交通便利，配套设施完善。

此外，罗湖区等其他区域也有软件公司分布，但数量相对较少。

综上所述，深圳的软件公司主要集中在南山区和福田区，这两个区域在软件产业方面有着明显的优势和发展潜力。