选择哪个操作系统进行软件工程，主要取决于个人的需求、熟悉程度以及特定的开发环境。以下是针对不同需求的建议：

Windows操作系统

优势：广泛的应用和支持，易于使用，兼容性高，适合使用Microsoft开发工具（如Visual Studio）的开发者。

劣势：安全性相对较低，容易受到病毒和恶意软件的攻击，性能在某些情况下可能受限。

macOS操作系统

优势：稳定性高，用户体验良好，适合长时间运行和大型项目开发，自带Xcode开发工具，适合开发iOS和macOS应用程序。

劣势：仅在苹果设备上运行，可能不适合所有用户。

Linux操作系统

优势：开源，自由度高，灵活性强，适合服务器端开发、嵌入式系统和科学计算等领域，性能稳定。

劣势：可能需要更多的技术知识和配置经验。

跨平台系统

优势：可以开发跨多个操作系统的应用程序，如Java、Python、Flutter等。

劣势：可能需要学习新的开发工具和框架。

建议

初学者：如果初学者对操作系统不熟悉，建议从Windows开始，因为Windows有丰富的图形界面和易于使用的开发工具。

移动应用开发者：如果主要开发iOS或macOS应用程序，建议使用macOS，因为它内置了Xcode开发工具。

服务器端开发者：如果需要处理大规模数据和高并发应用程序，或者对开源技术有兴趣，Linux是一个很好的选择。

跨平台应用开发者：如果需要开发跨多个操作系统的应用程序，可以考虑使用跨平台的开发工具和框架，如Java、Python、Flutter等。

综合考虑以上因素，可以根据个人或团队的具体需求选择最适合的操作系统。