根据搜索结果，软件工程专业优秀的大学可分为研究型和应用型两类，以下是综合多个权威来源的推荐：

一、研究型软件工程专业顶尖高校

北京大学

作为国内顶尖综合性大学，软件工程领域拥有国家特色专业，科研实力和学术影响力居全国首位。

浙江大学

与华为、阿里巴巴等企业合作紧密，提供丰富的企业导师资源，学术自由度较高。

北京航空航天大学

以工科见长，软件工程专业必修课程涵盖离散数学、算法分析等核心领域，毕业生就业竞争力强。

国防科技大学

在信息安全、嵌入式系统等领域突出，依托强军背景，就业方向覆盖军工及民用领域。

二、应用型软件工程专业强校

上海交通大学

长三角地区标杆高校，约60%毕业生优先进入本地企业，尤其在金融、互联网领域优势显著。

南京大学

学术与产业结合紧密，软件工程专业与多家知名企业建立联合培养机制。

天津师范大学

校企合作机制完善，毕业生可通过专场招聘会优先进入天津信息服务业企业。

重庆邮电大学

依托两江新区数字经济产业园，30%毕业生进入本地软件及通信企业。

烟台大学

通过校企合作进入烟台高新区及软件园企业，适合区域化就业需求。

三、其他值得关注的院校

新疆大学：

211工程院校，依托乌鲁木齐信息产业聚集地，毕业生易获本地企业青睐。

国防科技大学：非传统工科院校，IT领域实力突出，适合专项技术方向发展。

四、选择建议

目标为北上广深：优先考虑北京大学、清华大学、上海交通大学等，但需注意竞争压力。

倾向本地就业：天津师范大学、重庆邮电大学、烟台大学等提供较好支持。

关注特色方向：如国防科技、航空航天等领域的院校（如国防科技大学、北京航空航天大学），适合有明确职业规划的学生。

建议结合个人职业规划、地域偏好及学习能力，综合评估选择院校。